W O R K S H O P S
​Dr. Óscar Dias
Reconstrução de modelos metabólicos usando a ferramenta bioinformática merlin
O merlin é uma ferramenta JAVA, desenvolvida no CEB-UMinho, que usa informação do genoma para reconstruir modelos matemáticos do metabolismo, para qualquer organismo que tenha o genoma sequenciado.
Este software realiza os principais passos do processo de reconstrução, incluindo a anotação funcional de todo o genoma e subsequente construção do portfólio de reações. Além disso, o merlin inclui ferramentas para a identificação e anotação de genes que codificam proteínas de transporte, gerando as reações de transporte para esses transportadores. Também realiza a compartimentação do modelo, prevendo a localização das proteínas codificadas no genoma e, portanto, a localização dos metabolitos envolvidos nas reações promovidas por tais enzimas. Finalmente, agiliza a transição dos modelos metabólicos para o formato padrão SBML, permitindo uma visão preliminar da rede bioquímica.
Neste workshop iremos demonstrar as principais funcionalidades desta framework, explicando os passos necessários para se chegar das sequências ATCG até aos modelos estequiométricos.
Material Necessário: Computador com a ferramenta JAVA instalada
Dra. M. Sameiro Gonçalves e Dr. António Gil Fortes
Das essências aos perfumes – é uma questão de química
O isolamento dos óleos essenciais (essências) a partir de matérias-primas naturais obtidas de animais ou fontes vegetais é efetuado por diversas técnicas, incluindo destilação e extração com solventes.
Os óleos obtidos possuem muitas vezes componentes com potencial interesse em várias indústrias, nomeadamente na indústria de perfumes. Nesta atividade propõe-se o isolamento de essências a partir de fontes naturais de origem vegetal por diferentes métodos de extração (hidrodestilação, destilação por arraste de vapor e extração por soxhlet) e a sua caracterização por técnicas espetroscópicas (espetroscopia de ressonância magnética e espetroscopia de infravermelho).
As essências obtidas serão posteriormente usadas na formulação de vários perfumes, tendo os participantes oportunidade de preparar perfumes personalizados.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dra. Alice Dias
Pigmentos vegetais: extração, propriedades químicas e aplicações
Os pigmentos vegetais são moléculas de elevada valor comercial como corantes, antioxidantes, micronutrientes, nutracêuticos, fármacos, etc. São particularmente importantes nas indústrias farmacêutica, cosmética e alimentar pela sua atividade antioxidante poderosa, importante para combater o stress oxidativo do nosso organismo que está na origem do envelhecimento e de doenças graves.
Nesta atividade propõe-se a extração e separação dos pigmentos de fontes vegetais e discussão das suas aplicações com base nas propriedades físico-químicas apresentadas.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dra. Cecília Leão e Dra. Nadine Santos
Bioética, Integridade Científica e Responsabilidade Social
A Bioética é uma ética aplicada que visa ultrapassar os conflitos e controvérsias morais implicados pelas práticas no âmbito das Ciências da Vida e da Saúde do ponto de vista de algum sistema de valores. Neste workshop serão abordados temas como:
- Bioética em Ciência & Investigação: princípios, normas e diretivas
- Bioética e Integridade Científica
- Comissões de Ética: âmbito e competências
Numa parte final, será proposta uma análise de casos e respetivas tomadas de decisão: boas e más práticas em investigação.
Dra. Susana Costa
Determinação de aditivos em suplementos alimentares através de técnicas espetroscópicas
Neste workshop será feita a determinação de aditivos alimentares em suplementos alimentares comerciais (suplementos dietéticos, suplementos para desportistas, ...), nomeadamente a análise qualitativa e quantitativa através das técnicas de absorção no UV-vis e fluorescência.
O workshop será totalmente prático, com uma breve contextualização teórica do trabalho, com realização de trabalho experimental em laboratório, com os participantes organizados em grupos e com recurso a instrumentação de espetroscopia.
Material Necessário: Bata de Laboratório
MAIS NOVIDADES BREVEMENTE
Dra. Rute Moura
Desenvolvimento embrionário de Gallus gallus
A Biologia do Desenvolvimento é uma área da Biologia que se dedica ao estudo do desenvolvimento embrionário e que compreende o período entre o momento da fertilização e o nascimento. Os estudos nesta área têm um impacto muito significativo na saúde humana uma vez podem ajudar a tratar/prevenir malformações congénitas e melhorar o tratamento de doenças no adulto.
A investigação neste campo utiliza diferentes modelos animais, nomeadamente o modelo da galinha (Gallus gallus). O desenvolvimento embrionário de galinha é muito semelhante ao desenvolvimento embrionário humano em estadios muito precoces e é utilizado para estudar, por exemplo, o desenvolvimento pulmonar, entre outros. O conhecimento dos mecanismos moleculares subjacentes à formação do pulmão é essencial para compreender a fisiopatologia de doenças congénitas ou adquiridas, sendo fundamental para poder encontrar novos tratamentos para condições incuráveis.
Nesta atividade pretende-se dar a conhecer os diferentes estadios de desenvolvimento e as potencialidades/limitações do modelo de galinha, bem como a sua aplicação no estudo do desenvolvimento pulmonar.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dra. Rute Moura
Desenvolvimento embrionário de Gallus gallus
A Biologia do Desenvolvimento é uma área da Biologia que se dedica ao estudo do desenvolvimento embrionário e que compreende o período entre o momento da fertilização e o nascimento. Os estudos nesta área têm um impacto muito significativo na saúde humana uma vez podem ajudar a tratar/prevenir malformações congénitas e melhorar o tratamento de doenças no adulto.
A investigação neste campo utiliza diferentes modelos animais, nomeadamente o modelo da galinha (Gallus gallus). O desenvolvimento embrionário de galinha é muito semelhante ao desenvolvimento embrionário humano em estadios muito precoces e é utilizado para estudar, por exemplo, o desenvolvimento pulmonar, entre outros. O conhecimento dos mecanismos moleculares subjacentes à formação do pulmão é essencial para compreender a fisiopatologia de doenças congénitas ou adquiridas, sendo fundamental para poder encontrar novos tratamentos para condições incuráveis.
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Nesta atividade pretende-se dar a conhecer os diferentes estadios de desenvolvimento e as potencialidades/limitações do modelo de galinha, bem como a sua aplicação no estudo do desenvolvimento pulmonar.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dr. Alberto Dias
Investigação translacional em produtos naturais: na planta, da bancada para a prateleira
Nos anos recentes, a ciência tem provado que alguns extratos de plantas, óleos essenciais, e frações ou compostos isoladas podem ter um papel importante como fonte de princípios ativos com propriedades farmacológicas relevantes.
Tomando como base o conhecimento científico obtido, é possível produzir produtos de origem vegetal, de qualidade e bioatividade cientificamente comprovada, nomeadamente fitofarmacêuticos, alimentos funcionais e cosméticos.
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Neste workshop será abordada esta temática, dando exemplos concretos estudados no Dep. de Biologia, e os participantes terão oportunidade de discutir e participar ativamente.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dr. Rui Oliveira
Análise de atividade antioxidante de extractos de plantas por Citometria de Fluxo
Os extratos de plantas têm sido utilizados como agentes terapêuticos desde os tempos antigos. Muitos deles são a base de remédios modernos em que se identificou e isolaram os compostos com atividade farmacológica que passaram a ser usados nos medicamentos que adquirimos na farmácia. Com o aumento do conhecimento da biodiversidade vegetal e a descoberta de novos compostos biologicamente ativos, é provável que o potencial terapêutico das plantas esteja longe de ser totalmente explorado.
Muitos desses compostos têm atividade antioxidante, prevenindo a oxidação do DNA que ocorre devido a stresse, poluição ambiental (incluindo contaminantes de alimentos) e radiação, entre outras causas. A oxidação do DNA pode levar a mutações que podem acelerar o processo de envelhecimento e desencadear doenças degenerativas como diabetes, doenças neurológicas (Alzheimer, Parkinson) e cancro. Assim, o uso de plantas na pesquisa de novos compostos antioxidantes de origem natural pode contribuir para a descoberta de novos medicamentos que retardam o envelhecimento e previnam as doenças degenerativas.
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Nesta atividade propõe-se testar extratos de plantas em células sujeitas a stresse oxidativo. As experiências incluirão a análise da oxidação intracelular de células com um fluorocromo sensível à oxidação e deteção da fluorescência por citometria de fluxo.
Material Necessário: Bata de Laboratório
Dra. Maria Antónia Forjaz, Dra. Andreia Pacheco, Dra. Cristina Aguiar e Dra Judite Almeida.
Comunicar Scientia – da investigação à indústria
A comunicação faz parte da nossa vida quotidiana. Mesmo os cientistas necessitam de conversar, escrever documentos e propostas e de comunicar com uma variedade de públicos. Para se ser bem sucedido, independentemente do campo ou da carreira, todos devemos aprender a comunicar e a fazê-lo de modo eficaz e efetivo.
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Neste workshop, através de exemplos simples, mas úteis no dia a dia, pode encontrar-se modo e dicas para melhorar a comunicação, uma competência pessoal e profissional.
Dr. André Costa
A genética no mundo dos biopolímeros
Devido à escassez nas reservas de petróleo e à falta de biodegradabilidade dos polímeros convencionais, têm-se procurado novas alternativas a estes materiais. Neste sentido, os biopolímeros produzidos a partir de fontes renováveis, são cada vez mais usados.
No workshop vai-se debater conceitos básicos sobre biopolímeros com exemplos práticos bem como a importância da genética e a tecnologia de ADN recombinante na produção destes materiais extremamente versáteis e nas soluções que estes apresentam para problemas muito diversos.
Dra. Paula Sampaio
Sistema de PCR Multiplex para deteção de fungos patogénicos
As infeções fúngicas hospitalares são uma das principais causas de morte em pacientes imunocomprometidos, tanto em adultos como em pacientes pediátricos. Em estudos anteriores a nossa equipa desenvolveu uma metodologia para identificar as nove espécies de fúngicas mais frequentes (> 90%) em infeções sistémicas: Candida albicans, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida parapsilosis e Candida krusei, e Aspergillus fumigatus, Aspergillus flavus, Aspergillus niger e Aspergillus terreus. Este método pode ser usado nos laboratórios de microbiologia hospitalares para auxiliar no diagnóstico destas infeções de forma a aumentar a probabilidade de sobrevivência dos pacientes, reduzir o hospital custos e o desenvolvimento de resistência aos antifúngicos.
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Neste workshop este projeto será apresentado e discutido como o projeto iProof20 contribuiu para o desenvolvimento da prova-de-conceito para a possível comercialização da metodologia. Será ainda discutido como alunos com ideias empreendedores podem desenvolve-las e transforma-las em produtos.